संरेखण समस्या सर्वो एनकोडर के रखरखाव और प्रतिस्थापन की तकनीकी कठिनाई है, क्योंकि सामान्य सर्वो मोटर निर्माता प्रौद्योगिकी को गोपनीय रखने और प्रतिस्पर्धियों को अपने उत्पादों की नकल करने से रोकने के लिए, सर्वो एनकोडर के चुंबकीय ध्रुव मूल संरेखण के सिद्धांत का खुलासा नहीं करते हैं। और प्रत्येक कंपनी के सर्वो एनकोडर संरेखण का सिद्धांत समान नहीं है, जिससे सर्वो एनकोडर के रखरखाव में परेशानी होती है, आम तौर पर क्रैक करने के लिए एक अच्छे एनकोडर के साथ तुलना की विधि का उपयोग करें, ताकि सामान्य रखरखाव कंपनी एक बड़ी चुनौती हो रखरखाव प्रक्रिया अब पारंपरिक मल्टीमीटर समस्या को हल नहीं कर सकती है, और डेटा डोमेन की रखरखाव अवधारणा को अपनाने की आवश्यकता है। इसके अलावा, मरम्मत प्रक्रिया के दौरान एनकोडर के कोड डिस्क और सर्किट को आसानी से अलग न करें, अन्यथा अच्छी चीजें क्षतिग्रस्त हो सकती हैं।